中研院用網格運算加速禽流感疫苗開發

中央研究院所參與的歐盟EGEE（Enabling grid for eScienceE）計畫，日前宣布成功地在1個月內運用網格運算完成藥物結構分析，這項成果將加速禽流感疫苗的開發。

中央研究院基因研究中心吳盈達博士透露，此次透過網格運算的技術，利用全球2000～3000臺電腦進行網格運算，使用約137個CPU年的計算量，產生1400GB的資料量，讓藥物結構分析的周期，從原本需要130多年的計算，縮短至4周便可以完成。此次合作案，是目前全球最大的跨國藥物設計計算合作案例。

他進一步表示，以往科學家需要花較長的時間等待電腦計算的結果，以便檢視可能成為藥物的化學分子，網格運算系統，提供高產出計算與處理大量資料的能力，藥物化學家可以省下許多測試的時間，將省下的時間，專注在發現有初步療效的藥物上，對於禽流感這種傳染性強又迅速的病毒，增取時效尤其重要。

此次並非是網格運算首次運用在藥物開發上，中央研究院網格計算團隊專案經理李宏春表示，第一次運用於藥物開發上，主要是歐洲的研究單位，進行醫療網格計畫協助瘧疾的開發與篩選上，而禽流感的藥物開發，則是全球第二個利用網格運算的案例。

EGEE計畫是全球最大規模的網格運算應用環境，目前共有39個國家179個單位參與，此一運算環境大幅超越了任一個單位甚至是單一國家的計算能量，提供了跨越地理疆界的大規模計算環境，支援全球性的科學研究合作與應用，目前已應用於高能物理、生物醫學、地球科學等領域上。

網格運算藉由網際網路讓分散在全世界不同地區的電腦進行叢集，整合成一個電腦網路，透過這個電腦網路達到一個強大的數據處理能力，讓每一臺閒置的電腦資源都可以達到充分的利用，並讓每臺電腦達到最大的運作效能，中研院網格計算團隊主持人林誠謙表示，隨著網格運算的逐漸成熟，在未來將成為一個快速、方便並強而有利的工具，方便科學家進行更大規模的科學研究。

雖然目前網格運算運用的範圍，主要針對各個研究機構協助科學研究的運算，但對於網格運算未來的發展，中央研究院網格計算團隊專案經理陳信言表示，在未來網格運算將對人們有實質上的改變，首先，入口網站的設計將從靜態的查詢資料，變成執行運算的入口，比方說，透過入口網站，我們可以將執行的程式透過入口網站進行運算，並由入口網站傳遞運算的結果，這種結果將會形成「虛擬組織」的概念，透過這個「虛擬組織」，我們在電腦終端就不用安裝任何應用程式，透過後端的運算，來達到執行應用程式的效果，對人類的日常生活習慣將會是一大改變。文⊙林文彬