陽明大學用SOA加速流行感冒研究

陽明大學與IBM臺灣日前宣布一項合作計畫，雙方預計以服務導向架構（SOA）建置流行疫苗研發的系統平臺，陽明大學系統與合成生物學研究中心主任楊永正指出，透過SOA平臺，病毒株的分析作業時間，預計將可望從1個月縮短到1周以內。

目前流行疫苗研發的SOA平臺建置已經正式啟動，預計最晚將在2008年底上線。楊永正指出，每年冬天都是流行感冒的高峰期，一般大約會有5％～20％的人受到感染，然而，過去流感的研究與防治卻沒有辦法加速，因為過程中涉及許多流行病學假設，而每一個假設的驗證，就等於是一個新的流程，每一個流程所使用的工具與系統可能又有所不同，使得相關人員必須花費許多時間熟悉這些工具，進而建構流程，然後才能進一步分析並研發出適合的疫苗。

楊永正表示，透過SOA架構，則可以把這些分析工具直接轉變成服務模組或元件，相關人員只要利用這些模組，就可以快速組裝出相對應的流程，這樣的作業方式，將可在短時間內驗證更多假設，而病毒株的預測也將更準確。

根據目前的規畫來看，這個SOA平臺的服務模組，除了會以既有的生物資訊分析工具作為基礎，還會參考歐盟國家所制定的EMBOSS（European Molecular Biology Open Software Suite，序列分析程式組），實際的運用範疇，初期會以流行性感冒病毒分析為主，未來則可能會擴大到流行性疾病，例如：登革熱病毒以及肺結核等研究與預防分析。

事實上，陽明大學與IBM合作建置的SOA平臺，可以說是疾病管制局「病原微生物基因體資料庫」的延伸應用，楊永正進一步指出，相關人員著手研發流行疫苗之前，必須先完成病毒樣本收集與資料分析，而疾病管制局「病原微生物基因體資料庫」所累積的2萬多筆資料，就可以作為流行疫苗研發的基礎。

IBM生物資訊研發中心高級資訊工程師呂政欣表示，針對這個流行疫苗研發SOA平臺，IBM將免費提供所有的支援，其中除了基本的伺服器、中介軟體以及資料庫，乃至於顧問服務與訓練課程等都包括在內。陽明大學與IBM的合作正式啟動之後，預計近期內將優先完成軟硬體的基礎建置，第二階段的建置則著重在流行病學與基因序列分析等所需要的軟體工具等。

IBM自2001年起展開聯合大學研究計畫，每年並提供1億美元以上的軟硬體、技術及諮詢顧問，免費贊助學界進行為期1年以上的研究計畫。這次與陽明大學的合作，是全球第一個流行性感冒病毒分析的研究專案。文⊙楊惠芬

公司檔案－陽明大學
●專案名稱：流行性疾病分析系統與疫苗用病毒株篩選計畫
●專案成員：陽明大學系統與合成生物學研究中心、臺灣IBM
●專案時程：2007年12月啟動，預計2008年底前上線

應用效益
●陽明大學與IBM攜手建置的流行疫苗研發平臺，預計將藉由IBM的資料庫DB2以及中介軟體WebSphere等軟硬體建構SOA平臺，而服務模組將會以既有的生物資訊分析工具作為基礎，同時並參考EMBOSS（序列分析程式組）。
●預計流行疫苗研發的SOA平臺建置完成後，預計將能把病毒株的分析作業時間，從1個月縮短到1周以內；初期的應用，雖然是以流行性感冒病毒分析為主，不過，未來將會擴大到其他的流行性疾病研究與分析。