BioSilico 2000會議：生化學界數位資料格式統一，方能助益資訊科技研究

BioSilico 2000會議，重視資訊科技在生化學方面的應用

10月下旬在美國舉行的「BioSilico 2000」第一屆「生化資訊學與基因學會議」（Annual Bioinformatics & Genomics Conference）中，如何利用資訊科技來分析龐大的基因序列資料，使之能夠應用在製藥學上成為研發新藥的資訊與知識，成為一個討論重點。

IBM公司於去年底推出「Blue Gene藍色基因」超級電腦，最近更投入1億美元加強其生命科學部門的產品研發。Blue Gene超級電腦，標榜「有著超強的運算能力，能使科技研究界的模擬運算規模達到空前」，所針對的市場之一，便是協助研究人員進一步了解人體神經系統的運作機制、研發愛滋病治療藥物等，在生化及醫藥科學方面的應用。

但事實上，人類基因研究、以及其他的生化科技相關研究資料，到目前為止所累積的資料量之大，已經遠超過任何超級電腦的運算極限。如何能讓大量的資料真正「有用」，成為破解疾病、製造新藥的知識，是與會人士所關注的議題。基因與生化學的龐大資料，急需整合各式不同的資料格式

不過看來最主要的問題，是出在生化學界本身並沒有一套將「資料」轉換為數位格式的標準。比如基因圖譜、蛋白質分子構造、資料庫數據、文字檔、圖檔....等等各種格式的資料，尚無法經由同一套資訊系統探勘、擷取及運用。

所謂的「bioinformatics」生化資訊學，指的是結合化學、生物學、資訊科技的新學門。也有人使用「i-Biology」這個詞，來表述將生物學資訊化的努力。在這個領域裏，各學門的專家所使用的「資訊化」的方法是人言言殊，各有不同，連分子結構的畫法都不統一；「標準」在哪裏？莫衷一是。BioSilico 2000的與會人士咸認，趕緊協調出一個通用的生化資訊平台，是當務之急。

如此，方能允許全球各地的科學家們，都能輕易擷取到這些同屬全人類的生化資訊，也能更容易把自己研究所得與其他科學家進行溝通，加速揭露生命的奧秘，以及在製藥、疾病防制等方面的應用腳步。「生化資訊學」資訊系統的開發廠商

目前，在這方面進行產品開發的資訊廠商，有LionBioscience、Rosetta Inpharmatics、Agilent（HP惠普專司量測儀器等業務的衍生公司）等。其中LionBioscience開發的「Sequence Retrieval
System」（基因定序系統），企圖整合各式生化資料格式。

Rosetta Inpharmatics公司的「Resolver system」目前則有杜邦、Merck、Amgen等公司及哈佛大學等採用，是專門用來搜集、分析及比對蛋白質的構造；研究人員可利用此一系統，研究蛋白質分子的細微改變，如何影響細胞生理，進而研發藥物。

該公司也開發出「microarray」，或稱為biochip「生物晶片」，目前此一技術已轉移給了Agilent公司。